香港中文大学（深圳）理工学院与香港中文大学理学院持续加强深度合作。2025年6 月，港中大（深圳）理工学院在学术交流处的协调支持下正式推出港中大特别交流学习计划，为两校学生提供了更多元的交流学习机会。项目将于2025-2026 学年春季学期试行，并于2026-2027 学年起正式实施。届时港中大（深圳）理工学院每学年将选派20 名物理学、化学专业的优秀本科生，在大三学年前往港中大，参与为期一学期或一学年的交流学习（Visiting Program），拓宽学术视野，深度体验沙田校园氛围。

此外，物理学和化学专业的学生在大二和/ 或大三期间，有机会参与周末沉浸式交流考察，充分利用港中大理学院先进的实验室设施，在教授指导下完成部分实验课程，同时感受两个校园的独特文化魅力。